本片故事取材於真實事件。1937年12月13日,侵華日軍攻佔南京城,進行了慘無人道的大屠殺。爲了保護難民和中國軍人的生命安全,以寂然法師爲首的棲霞寺僧人自發組織起來,創辦佛教難民收容所,先後援助和安置難民24000多人。在與日軍的抗爭中,許多僧人慘死在日軍的槍口下。寂然法師等人不畏犧牲,一邊援助傷病難民,一邊設法保護抗日軍人,掩護他們安全過江,又冒着生命危險把記錄着日軍南京大屠殺罪證的膠片送出南京。在與日軍抗爭的過程中,手無寸鐵的中國僧人們面對死亡,毫不畏懼,以普渡衆生,慈悲爲懷的佛教教義爲武器,展開面對面的鬥爭,書寫公開信,揭露日軍暴行,與兇殘的日軍進行了一場人性與獸性的較量。最終正義戰勝邪惡,保全了千年古寺,保護了24000多難民的安全,全片弘揚了偉大的人道主義和愛國主義精神,弘揚佛教僧人高尚的愛國情操,展現一段鮮爲人知的故事。